SỨ MỆNH CỦA MỘT NHÀ NGHIÊN CỨU TIN SINH HỌC... LÀ GÌ?

Nếu bạn muốn bắt đầu hướng tới một hành trình trở thành một nhà Tin Sinh học. Trước tiên, bạn phải hiểu về một số thuật ngữ về Tin Sinh học. Đồng thời, bạn cũng cần biết đến các nhà Tin Sinh học làm gì?, và bạn cần phải biết làm gì ở cấp độ đầu tiên với tư cách là một nhà Tin Sinh học.

  Hầu hết các nhà Tin Sinh học hoạt động ở các lĩnh vực y tế khác nhau, bao gồm: Sinh học, di truyền, nghiên cứu về protein (proteomics), dược phẩm,... Nhiều chuyên gia đến từ nền nghiên cứu y sinh trong khi một số khác lại chuyên về các công cụ tính toán.

Như vậy, thế nào là nhà Tin Sinh học?

  Một nhà Tin Sinh học không chỉ sử dụng các công cụ để giúp hiểu biết hoặc giải quyết vấn đề sinh học, mà còn tham gia vào việc phát triển công cụ cho nghiên cứu. Nhà nghiên cứu Tin Sinh học được chia làm 2 loại: Loại đầu tiên là các nhà nghiên cứu về cách triển khai thuật toán và phát triển những công cụ giúp ích cho Tin Sinh học. Loại thứ hai bao gồm những nhà khoa học sẽ chịu trách nhiệm về tất cả các công việc có liên qua tới tài nguyên của dữ liệu và tích hợp dữ liệu.

Những yêu cầu về kỹ năng để trở thành nhà Tin Sinh học.

  Những kỹ năng Tin Sinh học - Bạn cần học như thế nào để có thể sử dụng?

- Các công cụ gióng trình tự như là BLAST hoặc BOWTIE

- Bộ công cụ dùng để phân tích bộ gen (GATK)

- Phần mềm để giải các trình tự ở thế hệ kế tiếp

- Những công cụ giúp xử lý trình tự dữ liệu (samtools)

- Công cụ tìm kiếm cơ sở dữ liệu (Entrez)

  Những kỹ năng về thống kế - Bạn cần phải học:

- Hệ thống phần mềm cho thống kê như SPSS và SAS

- Cách để phân tích thống kê với Python hoặc R

 Kỹ năng lập trình - Bạn cần phải quen thuộc với:

- Một hoặc nhiều hơn một ngôn ngữ lập trình, chẳng hạn như: R, Perl, Python, Java hay Matlab.

- Học một vài công cụ hay thư viện máy móc như là Mllib và Scikitl-Learn trong python, nơi chứa nhiều kiến thức hữu ích cho việc học của bạn,

  Kiến thức sinh học - Yêu cầu này sẽ thay đổi theo lĩnh vực của bạn hoặc các công việc cụ thể mà bạn áp dụng vào đó. Có có thể bạn sẽ phải cần những kiến thức về sinh học phân tử, di truyền, sinh học về ung thư, hoặc có thể là sinh học hiện đại.

  Kiến thức về di truyền học - Kiến thức này là phần cốt lõi của Tin Sinh học. Vài kỹ năng không kém phần quan trọng như là trình tự thông lượng cao, trình tự thế hệ tiếp theo và tính toán bộ gen.

  Quản lý cơ sở dữ liệu - Yêu cầu này bao gồm những quan hệ cơ sở dữ liệu truyền thống đó là cơ sở của SQL ( SQL server và Oracle). Hơn nữa, bạn cũng cần biết về cơ sở dữ liệu NoSQL cái mà không có khả năng mở rộng, phân phối, nguồn mở và cũng có thể mở rộng theo chiều ngang (MongoDB). Cuối cùng, có những cơ sở dữ liệu lớn (TCGA) và cơ sở phân tích dữ liệu lớn (Vertica). Đó là những thứ bạn nên học.

  Khai thác các dữ liệu - Học các khóa kỹ thuật như phân cụm cũng rất giúp ích cho bạn

  Kỹ năng cơ bản - Có nhiều kỹ năng bổ sung cũng khá quan trọng như là đa nhiệm, làm việc độc lập, kỹ năng giao tiếp tốt, sự tò mò,phân tích nguyên nhân và khả năng quản lý của bạn.

Dù bạn có là một nhà Tin Sinh học hay không, thì sứ mệnh của một nhà nghiên cứu về Khoa học luôn lấy lợi ích của con người lên trên hết. Hãy cố gắng tìm tòi và nghiên cứu về những gì con người chưa thể khám phá ra bạn nhé! Chúc các bạn luôn luôn thành công trên con đường nghiên cứu của mình

Tài liệu tham khảo:

 “ How to become a bioinformatician’’, bitesizeBio